《恋爱与选举与巧克力》故事主要讲述了主人公大岛裕树与青梅竹马住吉千里以及从以前起就是好友的同班同学木场美冬就读于以拥有超过五千名学生而自豪的工业学园“私立高藤学园”，同时他们还是以吃点心作为活动内容的社团食品研究部（通称：食研）的成员。次期自治学生会长的强力候选人东云皐月誓言要整顿杂乱且无实绩的社团活动，而其中食研更是首当其冲被指名要将其废部。为了避免面临危机的食研被废部，部员们想方设法开始行动起来了。